Сериал Батальон переносит нас с самое «пекло» 1999-ого года в Югославию, где кипит и бурно развивается конфликт между албанцами и сербами. С каждым днем конфликт двух наций вспыхивает в новой силой. Каждая сторона, пытаясь перетянуть на свою сторону большое количество взрывоопасной техники и оружия, жаждет так же получить и победу друг над другом. Россия, решая стратегически вмешаться, отправляет в «горячую точку» самых проверенных людей, задачей которых удержать в своих руках аэропорт , ведь он никому ещё не принадлежит, и не давать захватить его обеим сторонам. Если спецназовцы упустят стратегический важный объект, то это послужит хаосу по всей Югославии. Все положение спецназовцев «Главного управления Генерального штаба» усугубляется отсутствием оружия. Именно в этой непростой ситуации было принято решение о внедрении в тыл противника своего человека – Андрея. Но он встает перед выбором : спасти свою возлюбленную или свою команду? Справится ли он с выполнением этого непосильного выбора?