Все телеканалы взрываются новостями о том, как банда "Пурпурных Драконов" устроила схватку с четырьмя существами, очень похожими на гигантских Черепах. Однако наши герои, Черепашки-Ниндзя, абсолютно уверены, что эту злополучную ночь они провели дома в спокойной и умиротворяющей обстановке! Каково же было их удивление, когда визит в логово банды действительно сталкивает их лицом к лицу с Черепашками-Ниндзя... Из другого Измерения!
Впервые в истории кинематографа Черепашкам-Ниндзя мультсериала 2003 года предстоит бок о бок с Черепашками-Ниндзя классического мультсериала 1987 года сражаться против общих врагов, вместе спасать Эйприл и поглощать пиццу в безостановочном темпе! А также им предстоит узнать о тех Черепашках-Ниндзя, что 25 лет назад стали прародителями целой мультивселенной!